國立中興大學獸醫學系成立於民國59年，為我國早期建立完整獸醫教育體系的重要學府。其後陸續於民國69年完成家畜醫院興建並提供臨床實習，民國71年成立獸醫學研究所招收碩士班學生，民國79年大學部擴大招生成立雙班，民國82年起招收博士班研究生。民國84年家畜醫院更名為獸醫教學醫院 。民國83學年度成立獸醫微生物學研究所，招收碩士班學生，民國90學年度招收博士班學生。民國87學年度成立獸醫病理學研究所，於97學年度更名為獸醫病理生物學研究所。民國88年教育部正式核准通過本校成立全國第一所獸醫學院。民國92學年度獸醫公共衛生學研究所招收碩士班研究生。民國92年成立動物疾病診斷中心。獸醫公共衛生學研究所及獸醫微生物學研究所，於98年8月1日起整併為微生物暨公共衛生學研究所。以上的歷程奠定中興獸醫在獸醫教育、臨床醫療、動物防疫與公共衛生領域的地位，培育出世代相承、遍布各界的獸醫專業人才。
在母系長期發展的歷程中，系友始終是最重要的支持力量之一。為聯繫系友情誼、凝聚系友向心力，國立中興大學獸醫系友會於民國78年1月22日成立，初期以聯誼性社團方式運作，持續串聯不同世代之中興獸醫人。
民國108年，適逢母校百年校慶，系友會於「興大百年・獸興回娘家」活動中再次凝聚共識，並正式啟動依法立案之進程。即使面臨民國109年新冠肺炎疫情的嚴峻挑戰，仍由31位系友共同發起，於109年6月10日正式函文向內政部申請成立全國性人民團體，並於109年8月14日接獲內政部同意籌備函。
其後於109年9月20日召開第一次發起人暨第一次籌備會，109年10月7日刊登於太平洋日報公開徵求會員，109年12月17日召開第二次籌備會，110年1月17日召開成立大會，並於當天召開第一屆第一次理監事會，選出陳明遠獸醫師為第一屆理事長、吳亭儀獸醫師為第一屆常務監事、郭旭英獸醫師為第一屆秘書長，於110年2月22日由內政部獲准設立，並於110年12月16日正式通過成為「社團法人國立中興大學獸醫系友會」，象徵系友會邁入制度化、永續發展的新里程碑。
本會為依法設立、非以營利為目的之社會團體，以聯繫系友情感、加強團結力量、砥礪學術研究、開拓系友事業合作、協助母系發展為宗旨，並以宏揚母校「誠樸精勤」之精神為核心信念。在制度面，本會整合海內外系友資源，建立穩定之溝通與合作平台，協助母系於教學、研究、臨床與公共事務之推展；在情感面，則延續中興獸醫世代相承的情誼，使系友會成為每一位獸醫人隨時可回歸、彼此支持、共同前行的精神家園。
